RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ZPBP2Q6X784 338 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD23Q86SG2 305 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SAPCD2Q86UD0 394 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SLCO6A1Q86UG4 719 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TTC9BQ8N6N2 239 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NUP43Q8NFH3 380 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FNIP1Q8TF40 1166 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GPATCH3Q96I76 525 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 KIF2CQ99661 725 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA25Q9BR10 227 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SWAP70Q9UH65 585 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL3Q9UH77 587 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FAM221AA4D161 298 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NOBOXO60393 691 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 HTR3BO95264 441 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 LDHBP07195 334 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 CNR2P34972 360 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GYS2P54840 703 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FOXO4P98177 505 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NAALADL2Q58DX5 795 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 DPH6Q7L8W6 267 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PHC3Q8NDX5 983 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ATL2Q8NHH9 583 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GATAD2BQ8WXI9 593 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SAMD11Q96NU1 681 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 RAI14Q9P0K7 980 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 MRVI1Q9Y6F6 885 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 AK5Q9Y6K8 562 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GTL3 188 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 SIGLEC6O43699 453 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEF1O95521 474 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 GDF5P43026 501 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 RGS3P49796 1198 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 GJA9P57773 515 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 HTRA3P83110 453 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa3.77□□□□□ -1.81
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PTPRM-204ENST00000577468 MLECQ14165 292 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 PTPROQ16827 1216 aa3.77□□□□□ -1.81
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PTPRM-204ENST00000577468 ICE2Q659A1 982 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC146Q8IYE0 955 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
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PTPRM-204ENST00000577468 SCYL1Q96KG9 808 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 LNPKQ9C0E8 428 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 RNF38Q9H0F5 515 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 YY1AP1Q9H869 796 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 CHPF2Q9P2E5 772 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 TLR6Q9Y2C9 796 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 CFAP69A5D8W1 941 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRM-204ENST00000577468 CYBBP04839 570 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF20P17024 532 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 FBLN1P23142 703 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 LMNB2Q03252 620 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 PAQR3Q6TCH7 311 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 CARFQ8N187 725 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 MENTQ9BUN1 341 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 IMPACTQ9P2X3 320 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 ABCF2Q9UG63 623 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQ27 194 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQ64 194 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQC6 194 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQD8 194 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 CYR61O00622 381 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 SRGAP3O43295 1099 aa3.75□□□□□ -1.81
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