RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568153.1

CAPN3-218, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-218ENST00000568153 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 VPS37DQ86XT2 251 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 SPATA5Q8NB90 893 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 KCNB2Q92953 911 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 IL25Q9H293 177 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 STK32BQ9NY57 414 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 ABCC12Q96J65 1359 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 A0A0D9SFI3 127 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 C9orf172C9J069 976 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 H3BRJ5 948 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 SNAP23O00161 211 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 ZNF609O15014 1411 aa7.31□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 MCAMP43121 646 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 MAP3K12Q12852 859 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 MBTPS1Q14703 1052 aa7.31□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 SLC15A2Q16348 729 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.31□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 BTAF1O14981 1849 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 TM4SF5O14894 197 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 SLC27A2O14975 620 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 ADAM23O75077 832 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 ITPKAP23677 461 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 GNA15P30679 374 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 PARP2Q9UGN5 583 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 FSCN2O14926 492 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 FURINP09958 794 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 ALDH1B1P30837 517 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 GYG1P46976 350 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 FCGRTP55899 365 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 FGD1P98174 961 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 DOC2BQ14184 412 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 KRT32Q14532 448 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 HGSNATQ68CP4 663 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 SP8Q8IXZ3 490 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 OSBP2Q969R2 916 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 ZNF576Q9H609 170 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 C12orf49Q9H741 205 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPN3-218ENST00000568153 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 NUP98P52948 1817 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 CHGBP05060 677 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 MMP10P09238 476 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-218ENST00000568153 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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