RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	USP6NL	Q92738	828 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	SHISA4	Q96DD7	197 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	APBA2	Q99767	749 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	COL20A1	Q9P218	1284 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	POTEB2	H3BUK9	544 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	STRN	O43815	780 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	ADCY3	O60266	1144 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	DEXI	O95424	95 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	UBXN2A	P68543	259 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	HSCB	Q8IWL3	235 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	TRIB2	Q92519	343 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	PGBD1	Q96JS3	809 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	FGD4	Q96M96	766 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM260	Q9NX78	707 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	PNMA2	Q9UL42	364 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	ASTN1	O14525	1302 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	PFAS	O15067	1338 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	STK36	Q9NRP7	1315 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	SMCO2	A6NFE2	343 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	GNRH1	P01148	92 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	POLR2M	P0CAP2	368 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	CYP2C19	P33261	490 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	MCM2	P49736	904 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	ADCY7	P51828	1080 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	GUCY1B3	Q02153	619 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	MAML3	Q96JK9	1138 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	ALG1	Q9BT22	464 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	BARHL2	Q9NY43	387 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RPL4-208	ENST00000564744	INHA	P05111	366 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	GRK4	P32298	578 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	HSD17B4	P51659	736 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	PRMT2	P55345	433 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	NLRP5	P59047	1200 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	TRAF1	Q13077	416 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	CUL5	Q93034	780 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	MEIS2	O14770	477 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	HOXC6	P09630	235 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	GJB2	P29033	226 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	IRF5	Q13568	498 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	ARMCX2	Q7L311	632 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	IL31RA	Q8NI17	732 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	SNX21	Q969T3	373 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	C6orf50	Q9HD87	102 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	HMGCR	P04035	888 aa		9.75	□□□□□ -0.85
RPL4-208	ENST00000564744	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	9.75	□□□□□ -0.85

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