RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563597.5

PPP4C-206, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 3

Gene PPP4C, Length 815 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-206	ENST00000563597	CTAGE5	O15320	804 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	TOX2	Q96NM4	488 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597		Q9Y3F1	56 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597		B4DLN1	442 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	CLTB	P09497	229 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	SMPD1	P17405	629 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	FBXO11	Q86XK2	927 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	WTAP	Q15007	396 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	MYH6	P13533	1939 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	EDNRB	P24530	442 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	PDE4D	Q08499	809 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	BEX3	Q00994	111 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	GRM4	Q14833	912 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	AMN	Q9BXJ7	453 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	KIAA0355	O15063	1070 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	ZEB2	O60315	1214 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	CABYR	O75952	493 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	CHST3	Q7LGC8	479 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	BAD	Q92934	168 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	MTMR8	Q96EF0	704 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	LRCH3	Q96II8	777 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-206	ENST00000563597	CDK7	P50613	346 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	ANTXR2	P58335	489 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	FAAP100	Q0VG06	881 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	TROAP	Q12815	778 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	GPR153	Q6NV75	609 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	MTA3	Q9BTC8	594 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	ZBTB5	O15062	677 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	TBC1D5	Q92609	795 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	SENP2	Q9HC62	589 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	ARVCF	O00192	962 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	RAG1	P15918	1043 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	TRAF1	Q13077	416 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	SKAP1	Q86WV1	359 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	SCFD2	Q8WU76	684 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	PTGS1	P23219	599 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	CASC1	Q6TDU7	716 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	SLC27A2	O14975	620 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	MCM5	P33992	734 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	NECTIN1	Q15223	517 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	COL20A1	Q9P218	1284 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	ITGB8	P26012	769 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	CPT1A	P50416	773 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	GHRHR	Q02643	423 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	IWS1	Q96ST2	819 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	RMDN3	Q96TC7	470 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	MAP3K14	Q99558	947 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	LY9	Q9HBG7	655 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	TBX21	Q9UL17	535 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-206	ENST00000563597	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2

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