RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 LTBP2Q14767 1821 aa25.41■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 RAD50Q92878 1312 aa25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 CABYRO75952 493 aa25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 CDK7P50613 346 aa25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 TRDNQ13061 729 aa25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 Q9Y3F1 56 aa25.4■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 B4DLN1 442 aa25.39■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 PTGS1P23219 599 aa25.39■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 PDE4DQ08499 809 aa25.39■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.39■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 TIMP1P01033 207 aa25.38■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.38■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.38■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 CHMLP26374 656 aa25.37■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.37■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.37■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 DNERQ8NFT8 737 aa25.37■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 FAM161BQ96MY7 647 aa25.37■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 TBX21Q9UL17 535 aa25.37■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 EPHB4P54760 987 aa25.36■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 ITGA7Q13683 1181 aa25.36■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.36■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.36■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.36■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 ABCB11O95342 1321 aa25.36■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 LAMA4Q16363 1823 aa25.35■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.35■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.35■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 PPP2R5BQ15173 497 aa25.34■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.34■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 MFSD5Q6N075 450 aa25.34■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 FBXO11Q86XK2 927 aa25.34■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.34■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 TMEM199Q8N511 208 aa25.34■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 RGS22Q8NE09 1264 aa25.34■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 ERICH2A1L162 156 aa25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 CPT1AP50416 773 aa25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 PTH1RQ03431 593 aa25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 SCFD2Q8WU76 684 aa25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.33■■□□□ 1.65
CIPC-208ENST00000557115 MYL3P08590 195 aa25.32■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 CYP21A2P08686 494 aa25.32■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 PSMC6P62333 389 aa25.32■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.32■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.32■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 KLRF2D3W0D1 207 aa25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 EDNRBP24530 442 aa25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 SEC23AQ15436 765 aa25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 TBC1D5Q92609 795 aa25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 MAF1Q9H063 256 aa25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.31■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 SGSM2O43147 1006 aa25.3■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 CD4P01730 458 aa25.3■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 CSF2RAP15509 400 aa25.3■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 HIPK3Q9H422 1215 aa25.3■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 LCTP09848 1927 aa25.29■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 TTLL4Q14679 1199 aa25.29■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 NCOA7Q8NI08 942 aa25.29■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.29■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 AMNQ9BXJ7 453 aa25.29■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 GRIN2DO15399 1336 aa25.29■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 CYP2C18P33260 490 aa25.28■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.28■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 RMDN3Q96TC7 470 aa25.28■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.642e-10■■■■■ 50.3
CIPC-208ENST00000557115 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.28■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.28■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 E7EWF7 191 aa25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 B4GALT4O60513 344 aa25.27■■□□□ 1.64
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