RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	PDIA5	Q14554	519 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	STXBP3	O00186	592 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP2D6	P10635	497 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	INHBE	P58166	350 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SEPT2	Q15019	361 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF174	Q15697	407 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	E2F4	Q16254	413 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	MKL1	Q969V6	931 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DHX58	Q96C10	678 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	PANX2	Q96RD6	677 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	COL6A3	P12111	3177 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1B0GTH6	734 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	NR1I3	Q14994	352 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SCN9A	Q15858	1988 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	NMT2	O60551	498 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	STAT6	P42226	847 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	NAPA	P54920	295 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	GTF2I	P78347	998 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CUL4B	Q13620	913 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CNGA4	Q8IV77	575 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DPF3	Q92784	378 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	MCM7	P33993	719 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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