RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 SLC16A2P36021 539 aa29■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa29■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 DEFB128Q7Z7B8 93 aa29■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa29■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.99■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 ICAM1P05362 532 aa28.99■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.99■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.232e-6■■■■□ 25
MACROD1-208ENST00000545464 GBF1Q92538 1859 aa28.99■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.98■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 TTLL4Q14679 1199 aa28.98■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.98■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 TTBK2Q6IQ55 1244 aa28.98■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 POLR3EQ9NVU0 708 aa28.98■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 LRRC37A2A6NM11 1700 aa28.97■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 TNKSO95271 1327 aa28.97■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 PTPDC1A2A3K4 754 aa28.97■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.97■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.97■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 TOMM22Q9NS69 142 aa28.97■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.96■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 MORC4Q8TE76 937 aa28.96■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa28.96■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 DCAF4Q8WV16 495 aa28.96■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 VWCEQ96DN2 955 aa28.96■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 CERS4Q9HA82 394 aa28.96■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 REV3LO60673 3130 aa28.96■■■□□ 2.23
MACROD1-208ENST00000545464 NFIBO00712 420 aa28.95■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 CALML3P27482 149 aa28.95■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 CPT1AP50416 773 aa28.95■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 TMEM67Q5HYA8 995 aa28.95■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 GPCPD1Q9NPB8 672 aa28.95■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 RFXAPO00287 272 aa28.94■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 PURAQ00577 322 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 TFF2Q03403 129 aa28.94■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 SYDE2Q5VT97 1194 aa28.94■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.93■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 FOXP2O15409 715 aa28.93■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 CA3P07451 260 aa28.93■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 PFKMP08237 780 aa28.93■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 CHMP4BP1P59074 171 aa28.93■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 ACTN1P12814 892 aa28.92■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.92■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 VPS53Q5VIR6 699 aa28.92■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 SLC30A10Q6XR72 485 aa28.92■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 PDE4DQ08499 809 aa28.91■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 RETREG2Q8NC44 543 aa28.91■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 MX1P20591 662 aa28.9■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 AAK1Q2M2I8 961 aa28.9■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 RNF207Q6ZRF8 634 aa28.9■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 RAD50Q92878 1312 aa28.9■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 LCTP09848 1927 aa28.89■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 BMP1P13497 986 aa28.89■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 PPP2R5BQ15173 497 aa28.89■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 BTNL9Q6UXG8 535 aa28.89■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 TMEM47Q9BQJ4 181 aa28.89■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.89■■■□□ 2.22
MACROD1-208ENST00000545464 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 ORC4O43929 436 aa28.88■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 TOP1P11387 765 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 KCNQ1P51787 676 aa28.88■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 COPS5Q92905 334 aa28.88■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 NOD1Q9Y239 953 aa28.88■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 NOVP48745 357 aa28.87■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.87■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 ARNTL2Q8WYA1 636 aa28.87■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 MTCH2Q9Y6C9 303 aa28.87■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 BDP1A6H8Y1 2624 aa28.87■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa28.86■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 IQCF3P0C7M6 154 aa28.86■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 RFC2P35250 354 aa28.86■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
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MACROD1-208ENST00000545464 SLC9A7Q96T83 725 aa28.86■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.86■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 TRANK1O15050 2925 aa28.86■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 TXNP10599 105 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 RPS6P62753 249 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.85■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 SCFD2Q8WU76 684 aa28.85■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 SCN5AQ14524 2016 aa28.84■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 EPOPA6NHQ4 379 aa28.84■■■□□ 2.21
MACROD1-208ENST00000545464 KIF28PB7ZC32 967 aa28.84■■■□□ 2.21
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