RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	TCHH	Q07283	1943 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	NFIB	O00712	420 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	PEX10	O60683	326 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	BCR	P11274	1271 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	FCER1A	P12319	257 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	UBE2S	Q16763	222 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658		Q3C1V9	767 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	F13A1	P00488	732 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	FCGRT	P55899	365 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	NR5A1	Q13285	461 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	PORCN	Q9H237	461 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.58	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658		B4DLN1	442 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	MEIS2	O14770	477 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	STRN	O43815	780 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	BRD1	O95696	1058 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	HSD17B4	P51659	736 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	SP3	Q02447	781 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	PKP1	Q13835	747 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	OPLAH	O14841	1288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24	5e-14	■■■■■ 54.8
DDB1-223	ENST00000543658	DDIT3	P35638	169 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	GHRHR	Q02643	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	REST	Q13127	1097 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	NPY5R	Q15761	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	PTPRE	P23469	700 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	ADORA2A	P29274	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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