RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCL23P55773 120 aa22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITGA7Q13683 1181 aa22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 MTMR7Q9Y216 660 aa22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 CTAGE5O15320 804 aa22.65■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 TLL1O43897 1013 aa22.65■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZEB2O60315 1214 aa22.65■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYOGP15173 224 aa22.65■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARMCX2Q7L311 632 aa22.65■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 HLA-CQ95604 372 aa22.65■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIFC2Q96AC6 838 aa22.65■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.65■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 RIPK3Q9Y572 518 aa22.65■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.64■■□□□ 1.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZBED4O75132 1171 aa22.64■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 BMP3P12645 472 aa22.64■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 MCCP23508 829 aa22.64■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNFAIP2Q03169 654 aa22.64■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.64■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.64■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 GBF1Q92538 1859 aa22.64■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 BEX3Q00994 111 aa22.63■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 CPXCR1Q8N123 301 aa22.63■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHST13Q8NET6 341 aa22.63■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.63■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 REV3LO60673 3130 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAD50Q92878 1312 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM232C9JQI7 657 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC1A4P43007 532 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 NOVP48745 357 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC4A3P48751 1232 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTH1RQ03431 593 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCTD1Q719H9 257 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 FEM1BQ9UK73 627 aa22.62■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRANK1O15050 2925 aa22.61■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 CA3P07451 260 aa22.61■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 GMCL1Q96IK5 515 aa22.61■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.61■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 KATNBL1Q9H079 304 aa22.61■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.61■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 B4E1Z4 1266 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 B4GALT4O60513 344 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACTN1P12814 892 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 OAZ1P54368 228 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 TLK2Q86UE8 772 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 ESR2Q92731 530 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 FGD4Q96M96 766 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 RFXAPO00287 272 aa22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 SGSM2O43147 1006 aa22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 KDM4AO75164 1064 aa22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q9Y3F1 56 aa22.59■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRIN2DO15399 1336 aa22.58■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 ASB14A6NK59 587 aa22.58■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF28PB7ZC32 967 aa22.58■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 STAT2P52630 851 aa22.58■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNAP25P60880 206 aa22.58■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC96Q2M329 555 aa22.58■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCLYQ96I15 445 aa22.58■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC9A7Q96T83 725 aa22.58■■□□□ 1.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 ASTN1O14525 1302 aa22.57■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 FDX1P10109 184 aa22.57■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTLL4Q14679 1199 aa22.57■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.57■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.57■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 CERS4Q9HA82 394 aa22.57■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms