RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 ADAMTS3O15072 1205 aa21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 TRPA1O75762 1119 aa21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 CFBP00751 764 aa21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 HSD17B4P51659 736 aa21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 OXER1Q8TDS5 423 aa21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 TBC1D5Q92609 795 aa21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 EFCC1Q9HA90 598 aa21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 BTBD18B2RXH4 712 aa21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 TBC1D8O95759 1140 aa21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 POLR2MP0CAP2 368 aa21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 UBE2SQ16763 222 aa21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 MCTP1Q6DN14 999 aa21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 NSMFQ6X4W1 530 aa21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 TNFRSF25Q93038 417 aa21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 PFASO15067 1338 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 BRD1O95696 1058 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 MAPK4P31152 587 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 NUCB2P80303 420 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 NR5A1Q13285 461 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 KIF28PB7ZC32 967 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 WDR78Q5VTH9 848 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 MCTP2Q6DN12 878 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 FCER1AP12319 257 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 AP3B2Q13367 1082 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 FERMT3Q86UX7 667 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 MMP19Q99542 508 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 TMEM260Q9NX78 707 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 STRNO43815 780 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 F13A1P00488 732 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 RESTQ13127 1097 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 KCTD2Q14681 263 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 GPR142Q7Z601 462 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 COL20A1Q9P218 1284 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-217ENST00000531951 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 BRAPQ7Z569 592 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 ANO3Q9BYT9 981 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 SP3Q02447 781 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 GRB14Q14449 540 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.045e-8■■■■■ 37.9
PUF60-217ENST00000531951 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 WBP1LQ9NX94 342 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 FAM205CA6NFA0 338 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 PTPREP23469 700 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 PGBD1Q96JS3 809 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 RPTORQ8N122 1335 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 POTEB2H3BUK9 544 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 GPR25O00155 361 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 ADORA2AP29274 412 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 CNTN2Q02246 1040 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-217ENST00000531951 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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