RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MARCH6O60337 910 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NMT2O60551 498 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MFAP3LO75121 409 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPFIA3O75145 1194 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRIM37O94972 964 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CYP3A4P08684 503 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CYP2D6P10635 497 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCP2P22307 547 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CIITAP33076 1130 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HSPA1LP34931 641 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CRKP46108 304 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZBED6P86452 979 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DDR1Q08345 913 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCNJ12Q14500 433 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 INF2Q27J81 1249 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LETM2Q2VYF4 491 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 Q4G0T1 1027 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM83AQ86UY5 434 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM160B2Q86V87 743 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TBCKQ8TEA7 893 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UBXN4Q92575 508 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 P2RX5Q93086 422 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MBOAT7Q96N66 472 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DNAJC7Q99615 494 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AMNQ9BXJ7 453 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MYO6Q9UM54 1294 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COL4A1P02462 1669 aa7.56□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANO9A1A5B4 782 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 USO1O60763 962 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ERLIN1O75477 346 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SHMT1P34896 483 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRCPP42785 496 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC1A4P43007 532 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAP3K9P80192 1104 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GPS2Q13227 327 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRT31Q15323 416 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VWA3BQ502W6 1294 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM139Q8IV31 216 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OGFOD1Q8N543 542 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NEK9Q8TD19 979 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RABGGTAQ92696 567 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GOPCQ9HD26 462 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNF14Q9UBS8 474 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TSKSQ9UJT2 592 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CTAGE9A4FU28 777 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 USP17L5A8MUK1 530 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KLRC4O43908 158 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CLSTN1O94985 981 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 APBA3O96018 575 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MMP10P09238 476 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRR29P0C7W0 189 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRLRP16471 622 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAP43P17677 238 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RXRBP28702 533 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TNNI2P48788 182 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ASIC1P78348 528 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UBXN1Q04323 297 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GRIN1Q05586 938 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITIH3Q06033 890 aa7.54□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PDE4DQ08499 809 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms