RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 STRNO43815 780 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 CFBP00751 764 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 TNFRSF25Q93038 417 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 EFCC1Q9HA90 598 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 PFASO15067 1338 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 BTBD18B2RXH4 712 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 BRD1O95696 1058 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D8O95759 1140 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 AP3B2Q13367 1082 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 PKP1Q13835 747 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D5Q92609 795 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 OXER1Q8TDS5 423 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 WBP1LQ9NX94 342 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAMTS3O15072 1205 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 FCER1AP12319 257 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 NSMFQ6X4W1 530 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 NR5A1Q13285 461 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 KCTD2Q14681 263 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR142Q7Z601 462 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 UBE2SQ16763 222 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 MCTP1Q6DN14 999 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 BRAPQ7Z569 592 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF28PB7ZC32 967 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 SP3Q02447 781 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 MMP19Q99542 508 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPREP23469 700 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 RESTQ13127 1097 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 GRB14Q14449 540 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 JMYQ8N9B5 988 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 COL20A1Q9P218 1284 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR25O00155 361 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 F13A1P00488 732 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR78Q5VTH9 848 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 DNERQ8NFT8 737 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM260Q9NX78 707 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 FERMT3Q86UX7 667 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 ANO3Q9BYT9 981 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 RPTORQ8N122 1335 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 POTEB2H3BUK9 544 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 ADORA2AP29274 412 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 SREBF1P36956 1147 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 FCGRTP55899 365 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 MORN1Q5T089 497 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAPPC10P48553 1259 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 RMDN3Q96TC7 470 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXC6P09630 235 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 CTGFP29279 349 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMC4P43686 418 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF22Q14807 665 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-205ENST00000528462 USP6NLQ92738 828 aa25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms