RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526458.1

C9orf135-AS1-203, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 VTI1AQ96AJ9 217 aa13.58□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MAF1Q9H063 256 aa13.58□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 AP5M1Q9H0R1 490 aa13.58□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 Q9Y3F1 56 aa13.58□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MYH7BA7E2Y1 1941 aa13.58□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 B4DLN1 442 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ARVCFO00192 962 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TLR3O15455 904 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CABYRO75952 493 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ITGB8P26012 769 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CALML3P27482 149 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CDK7P50613 346 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 BEX3Q00994 111 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TRDNQ13061 729 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SHHQ15465 462 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 USH1GQ495M9 461 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DNERQ8NFT8 737 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 UBA5Q9GZZ9 404 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PDGFCQ9NRA1 345 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CDH23Q9H251 3354 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ABCB11O95342 1321 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GBF1Q92538 1859 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TANC1Q9C0D5 1861 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CHMLP26374 656 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FPGSQ05932 587 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 C9orf50Q5SZB4 431 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 Q7L0L9 218 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FAM126BQ8IXS8 530 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ADGRF4Q8IZF3 695 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RGS22Q8NE09 1264 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CPVLQ9H3G5 476 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TBX21Q9UL17 535 aa13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 EYSQ5T1H1 3165 aa13.55□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TIMP1P01033 207 aa13.55□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CYP21A2P08686 494 aa13.55□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 EDNRBP24530 442 aa13.55□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PDE4DQ08499 809 aa13.55□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 WDR11Q9BZH6 1224 aa13.55□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ERICH2A1L162 156 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SGSM2O43147 1006 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CPT1AP50416 773 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ITGA7Q13683 1181 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPP2R5BQ15173 497 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SEC23AQ15436 765 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 QRICH1Q2TAL8 776 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF697Q5TEC3 545 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MFSD5Q6N075 450 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SLC43A3Q8NBI5 491 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.54□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CD4P01730 458 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PTGS1P23219 599 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PTH1RQ03431 593 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TMEM63BQ5T3F8 832 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FBXO11Q86XK2 927 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TMEM199Q8N511 208 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 OR6J1Q8NGC5 347 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NCOA7Q8NI08 942 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SCFD2Q8WU76 684 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 POLR3EQ9NVU0 708 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.52□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KLRF2D3W0D1 207 aa13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 EPHB4P54760 987 aa13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 AMNQ9BXJ7 453 aa13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 VAT1LQ9HCJ6 419 aa13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MAD2L2Q9UI95 211 aa13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SCN5AQ14524 2016 aa13.52□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 E7EWF7 191 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms