RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 DGKHQ86XP1 1220 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 MYLIPQ8WY64 445 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 NUCB1Q02818 461 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM240Q5SV17 173 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 HIPK3Q9H422 1215 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 ACRP10323 421 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJB2P25686 324 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP2C18P33260 490 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CPT1AP50416 773 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF365Q70YC5 407 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 KAT14Q9H8E8 782 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHDP01880 384 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 FGBP02675 491 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 SNHG28P0DPA3 235 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 DNERQ8NFT8 737 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 TIFAQ96CG3 184 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 IL23AQ9NPF7 189 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 RAD50Q92878 1312 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM4AO75164 1064 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 MYL3P08590 195 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMC6P62333 389 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF576Q9H609 170 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 PTGS1P23219 599 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP2R5BQ15173 497 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 USH1GQ495M9 461 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 PNMA1Q8ND90 353 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 MSRAQ9UJ68 235 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 NEDD4P46934 1319 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 B4GALT4O60513 344 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 KPNA6O60684 536 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 RGS22Q8NE09 1264 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 SCFD2Q8WU76 684 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT23Q9C075 422 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 MAF1Q9H063 256 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 GRIN2DO15399 1336 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL23P55773 120 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 GRIN2CQ14957 1233 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 HERVK_113Q902F9 699 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 B4E1Z4 1266 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 TTLL4Q14679 1199 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB30Q15771 203 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 RASIP1Q5U651 963 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKS1AQ92625 1134 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCB11O95342 1321 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-220ENST00000511663 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 PBX4Q9BYU1 374 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 CPVLQ9H3G5 476 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-220ENST00000511663 COL6A3P12111 3177 aa22.5■■□□□ 1.19
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