RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511207.5

CCNH-209, Transcript of cyclin H, human

TSL 2

Gene CCNH, Length 451 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-209	ENST00000511207	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	WNT9A	O14904	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GPR39	O43194	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ZNF205	O95201	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	RASGRP1	O95267	797 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CD3E	P07766	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	BPI	P17213	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	KCNA6	P17658	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	SEPHS1	P49903	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	EPHB1	P54762	984 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	LRP8	Q14114	963 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ZNF460	Q14592	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	MMP19	Q99542	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TTC1	Q99614	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	STXBP3	O00186	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ADM	P35318	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	EVA1C	P58658	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	STRN3	Q13033	797 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	STAT4	Q14765	748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	RELT	Q969Z4	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	HMX2	A2RU54	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	CBX4	O00257	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	ARNTL	O00327	626 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	MEIS1	O00470	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	KPNA6	O60684	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	COBL	O75128	1261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	F2	P00734	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	PLS3	P13797	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	IFNGR1	P15260	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	SCNN1B	P51168	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	CLCN7	P51798	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	OXCT1	P55809	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	PAK1	Q13153	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	SLC51A	Q86UW1	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	DIO2	Q92813	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	USP7	Q93009	1102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	GSTA4	O15217	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	GSC2	O15499	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	PAM	P19021	973 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	FAP	Q12884	760 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-209	ENST00000511207	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms