RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490709.1

GLIS3-216, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 768 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-216ENST00000490709 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
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GLIS3-216ENST00000490709 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.62■■□□□ 1.37
GLIS3-216ENST00000490709 A0A1W2PPC1 479 aa23.62■■□□□ 1.37
GLIS3-216ENST00000490709 SMPD1P17405 629 aa23.62■■□□□ 1.37
GLIS3-216ENST00000490709 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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GLIS3-216ENST00000490709 COL20A1Q9P218 1284 aa23.56■■□□□ 1.36
GLIS3-216ENST00000490709 Q9Y3F1 56 aa23.56■■□□□ 1.36
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GLIS3-216ENST00000490709 CYTH3O43739 400 aa23.55■■□□□ 1.36
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GLIS3-216ENST00000490709 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.55■■□□□ 1.36
GLIS3-216ENST00000490709 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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GLIS3-216ENST00000490709 TRAF1Q13077 416 aa23.54■■□□□ 1.36
GLIS3-216ENST00000490709 PPP2R5BQ15173 497 aa23.54■■□□□ 1.36
GLIS3-216ENST00000490709 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.54■■□□□ 1.36
GLIS3-216ENST00000490709 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.54■■□□□ 1.36
GLIS3-216ENST00000490709 BADQ92934 168 aa23.54■■□□□ 1.36
GLIS3-216ENST00000490709 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.54■■□□□ 1.36
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