RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.55■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 FOXP2O15409 715 aa20.54■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 PFKMP08237 780 aa20.54■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 NOVP48745 357 aa20.54■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.54■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.53■□□□□ 0.88
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PKDCC-208ENST00000490302 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 SLC16A2P36021 539 aa20.53■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 CPT1AP50416 773 aa20.53■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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PKDCC-208ENST00000490302 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.53■□□□□ 0.88
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PKDCC-208ENST00000490302 VWCEQ96DN2 955 aa20.53■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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PKDCC-208ENST00000490302 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.53■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.53■□□□□ 0.88
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PKDCC-208ENST00000490302 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PKDCC-208ENST00000490302 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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PKDCC-208ENST00000490302 NFIBO00712 420 aa20.52■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 ORC4O43929 436 aa20.52■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 MX1P20591 662 aa20.52■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 TTLL4Q14679 1199 aa20.52■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.52■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 TOMM22Q9NS69 142 aa20.52■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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PKDCC-208ENST00000490302 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.51■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 VPS53Q5VIR6 699 aa20.51■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.51■□□□□ 0.87
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PKDCC-208ENST00000490302 CALML3P27482 149 aa20.5■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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PKDCC-208ENST00000490302 GBF1Q92538 1859 aa20.5■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 RAD50Q92878 1312 aa20.49■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 RFC2P35250 354 aa20.49■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 PDE4DQ08499 809 aa20.49■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.49■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.49■□□□□ 0.87
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PKDCC-208ENST00000490302 KPNA6O60684 536 aa20.48■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 CA3P07451 260 aa20.48■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 PPP2R5BQ15173 497 aa20.48■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 ALX1Q15699 326 aa20.48■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 RETREG2Q8NC44 543 aa20.48■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.48■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 SLC9A7Q96T83 725 aa20.48■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.48■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.48■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 AAK1Q2M2I8 961 aa20.47■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.47■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 SCFD2Q8WU76 684 aa20.47■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 EVI5LQ96CN4 794 aa20.47■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 RFXAPO00287 272 aa20.46■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 PDHBP11177 359 aa20.46■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.46■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.46■□□□□ 0.87
PKDCC-208ENST00000490302 A6NJR5 290 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 PITPNM1O00562 1244 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 FGAP02671 866 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 IQCF3P0C7M6 154 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 BMP1P13497 986 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 EDNRBP24530 442 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 TFF2Q03403 129 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 DNERQ8NFT8 737 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 COPS5Q92905 334 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 CERS4Q9HA82 394 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 TTC28Q96AY4 2481 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.45■□□□□ 0.86
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