RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZUG5 572 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 RARBP10826 455 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 FBXL16Q8N461 479 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 MCM3APO60318 1980 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 ADCY6O43306 1168 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 GHRHRQ02643 423 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 DNERQ8NFT8 737 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 COL20A1Q9P218 1284 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 DNM1LO00429 736 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB43O43298 467 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 FGD1P98174 961 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 TRAF1Q13077 416 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 LRRC41Q15345 812 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 MYH6P13533 1939 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 PGK1P00558 417 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 CFBP00751 764 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 EDNRBP24530 442 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B4P51659 736 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 APOBRQ0VD83 1088 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 RUFY3Q7L099 469 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 DPF3Q92784 378 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 BRF1Q92994 677 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS4O75173 837 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 RCAN1P53805 252 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 VTA1Q9NP79 307 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 RTN1Q16799 776 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 KBTBD13C9JR72 458 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 CDC27P30260 824 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 TNFAIP2Q03169 654 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 PDE4DQ08499 809 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 FUT2Q10981 343 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 SEC24BO95487 1268 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 SMPD1P17405 629 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 RNF180Q86T96 592 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 RMDN3Q96TC7 470 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 MYADML2A6NDP7 307 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 B4DLN1 442 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 POLR2MP0CAP2 368 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 EVCP57679 992 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 GJA9P57773 515 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms