RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 TBC1D7Q9P0N9 293 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -06e-6■□□□□ 10.8
NISCH-207ENST00000479054 CCND2P30279 289 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 STAT2P52630 851 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 GSDMAQ96QA5 445 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-207ENST00000479054 LAD1O00515 517 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ABI1Q8IZP0 508 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 WDR11Q9BZH6 1224 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 COPB2P35606 906 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 LIG4P49917 911 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 KRT19P08727 400 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 FAM102BQ5T8I3 360 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 SPATA1Q5VX52 437 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 DGKHQ86XP1 1220 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 MAGEF1Q9HAY2 307 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 NELFCDQ8IXH7 590 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 SP8Q8IXZ3 490 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 MORC3Q14149 939 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 KCNJ18B7U540 433 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 DAPK3O43293 454 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ERCC3P19447 782 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 KCNJ12Q14500 433 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 CEP57Q86XR8 500 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 GSG1L2A8MUP6 293 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ECE2O60344 883 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ASIC2Q16515 512 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 MTA3Q9BTC8 594 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 IL25Q9H293 177 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 MYOM1P52179 1685 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 A0A087WWV3 80 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 EVCP57679 992 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 SYDE2Q5VT97 1194 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 LRFN2Q9ULH4 789 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ZNF609O15014 1411 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 IKBKBO14920 756 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 TUBBP07437 444 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 PPP2R3AQ06190 1150 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ADGRB2O60241 1585 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 NDC80O14777 642 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 CHGBP05060 677 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 TNNI1P19237 187 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 STIM2Q9P246 746 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 SLFN14P0C7P3 912 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 CD19P15391 556 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 CLUL1Q15846 466 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 GPBP1Q86WP2 473 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 CCDC51Q96ER9 411 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 PSMD1Q99460 953 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 LY9Q9HBG7 655 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 ELF2Q15723 593 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 SLIT1O75093 1534 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 HSF2BPO75031 334 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 CRKP46108 304 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 CDK8P49336 464 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-207ENST00000479054 RNF169Q8NCN4 708 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms