RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-208	ENST00000477447	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	DIO2	Q92813	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	MMP19	Q99542	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SP110	Q9HB58	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	BIN1	O00499	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NPHS1	O60500	1241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	PAPLN	O95428	1278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	EFEMP2	O95967	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TACR1	P25103	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	LTBR	P36941	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	RNF32	Q9H0A6	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	C7orf72	A4D263	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ARNTL	O00327	626 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	MYO1B	O43795	1136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	CDC45	O75419	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	LCP1	P13796	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	PRKCA	P17252	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ASMTL	O95671	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ITGB5	P18084	799 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	MVK	Q03426	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TESK1	Q15569	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM168A	Q92567	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	APPBP2	Q92624	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	GLI1	P08151	1106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ARL4A	P40617	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	CORO7	P57737	925 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	GABRE	P78334	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	CYP4F8	P98187	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SNX17	Q15036	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	MSC	O60682	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	FUCA1	P04066	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PNLIP	P16233	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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