RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
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ARHGEF3-208ENST00000477440 TMTC3Q6ZXV5 915 aa29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF3-208ENST00000477440 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.42■■■□□ 2.3
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ARHGEF3-208ENST00000477440 COL20A1Q9P218 1284 aa29.4■■■□□ 2.3
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ARHGEF3-208ENST00000477440 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.39■■■□□ 2.3
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ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM184BQ9ULE4 1060 aa29.39■■■□□ 2.3
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ARHGEF3-208ENST00000477440 DNERQ8NFT8 737 aa29.38■■■□□ 2.29
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ARHGEF3-208ENST00000477440 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF3-208ENST00000477440 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa29.36■■■□□ 2.29
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ARHGEF3-208ENST00000477440 COL6A1P12109 1028 aa29.36■■■□□ 2.29
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ARHGEF3-208ENST00000477440 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 POLR2MP0CAP2 368 aa29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANAPC15P60006 121 aa29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 RNF180Q86T96 592 aa29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 SAMD3Q8N6K7 520 aa29.3■■■□□ 2.28
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