RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	SLC25A27	O95847	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	CFB	P00751	764 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	COPB2	P35606	906 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	MAP2K2	P36507	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	HSD17B4	P51659	736 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	GHRHR	Q02643	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	CRHR2	Q13324	411 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	CA12	O43570	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	TLR2	O60603	784 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	BCR	P11274	1271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	ERCC3	P19447	782 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	CCNA1	P78396	465 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	PORCN	Q9H237	461 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	MAF1	Q9H063	256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	MROH8	Q9H579	483 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	PFAS	O15067	1338 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	INF2	Q27J81	1249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	WNT7A	O00755	349 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	TBCK	Q8TEA7	893 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	MMP19	Q99542	508 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	RPTOR	Q8N122	1335 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	FCER1A	P12319	257 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	MAPK4	P31152	587 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	SREBF1	P36956	1147 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	TRAPPC10	P48553	1259 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	NBR1	Q14596	966 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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