RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463574.1

HLA-B-251, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-251ENST00000463574 SNHG28P0DPA3 235 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 ALAS1P13196 640 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 DNAJB2P25686 324 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 OAZ1P54368 228 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 ANTXR2P58335 489 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 GNASQ5JWF2 1037 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 FGD4Q96M96 766 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 SENP2Q9HC62 589 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 TBX21Q9UL17 535 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-251ENST00000463574 ERICH2A1L162 156 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 CDK7P50613 346 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 GJA9P57773 515 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 GRIN2CQ14957 1233 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 WTAPQ15007 396 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 MFSD5Q6N075 450 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 ARMCX2Q7L311 632 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 RNF146Q9NTX7 359 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 TTC28Q96AY4 2481 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 CDH23Q9H251 3354 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 ARVCFO00192 962 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 CNTN2Q02246 1040 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 ZNF576Q9H609 170 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 ACAD9Q9H845 621 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 VCANP13611 3396 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.62□□□□□ -0.07
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HLA-B-251ENST00000463574 TMEM240Q5SV17 173 aa14.62□□□□□ -0.07
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HLA-B-251ENST00000463574 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 TMEM199Q8N511 208 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 TIFAQ96CG3 184 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.62□□□□□ -0.07
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HLA-B-251ENST00000463574 ACRP10323 421 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 CSF2RAP15509 400 aa14.61□□□□□ -0.07
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HLA-B-251ENST00000463574 LY9Q9HBG7 655 aa14.59□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.59□□□□□ -0.07
HLA-B-251ENST00000463574 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-251ENST00000463574 KLRF2D3W0D1 207 aa14.58□□□□□ -0.08
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