RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456385.5

CLIP4-208, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, human

TSL 2

Gene CLIP4, Length 2,311 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP4-208	ENST00000456385	LRRC15	Q8TF66	581 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	DISC1	Q9NRI5	854 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	DNM1L	O00429	736 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ERCC3	P19447	782 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	NF2	P35240	595 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	IFT20	Q8IY31	132 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	RETREG2	Q8NC44	543 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	MIEF2	Q96C03	454 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	RCAN1	P53805	252 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	RASSF7	Q02833	373 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	EMC10	Q5UCC4	262 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	IQCA1	Q86XH1	822 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	AKR1B10	O60218	316 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CDR1	P51861	262 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	NLRP5	P59047	1200 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CDK17	Q00537	523 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	TROAP	Q12815	778 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	QPCT	Q16769	361 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	SCLT1	Q96NL6	688 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	PLAA	Q9Y263	795 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	MYH6	P13533	1939 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CHD4	Q14839	1912 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ATP2C2	O75185	946 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	FCER1A	P12319	257 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	TMOD1	P28289	359 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	STK4	Q13043	487 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	E2F5	Q15329	346 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ESR2	Q92731	530 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	KRT12	Q99456	494 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	OPLAH	O14841	1288 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	PAX7	P23759	505 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	MAGEA1	P43355	309 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	PAK2	Q13177	524 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	KCNB1	Q14721	858 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	PLCB4	Q15147	1175 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	CD302	Q8IX05	232 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	LPIN2	Q92539	896 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	P2RX5	Q93086	422 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLIP4-208	ENST00000456385	FTCD	O95954	541 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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