RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, human

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRA-208	ENST00000455631	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	COG5	Q9UP83	839 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	MCC	P23508	829 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631		M0R2C6	588 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	MYL3	P08590	195 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	TFAP4	Q01664	338 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	PDE4B	Q07343	736 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	KCTD1	Q719H9	257 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRA-208	ENST00000455631	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	ARHGEF15	O94989	841 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	CPT1A	P50416	773 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	TAP1	Q03518	808 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	HLA-C	Q95604	372 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	TRANK1	O15050	2925 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	PLA2G6	O60733	806 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	RFC2	P35250	354 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	MORC4	Q8TE76	937 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	STX8	Q9UNK0	236 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	KIF28P	B7ZC32	967 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	TLL1	O43897	1013 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	MTMR7	Q9Y216	660 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	RETREG2	Q8NC44	543 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	GPATCH3	Q96I76	525 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	IQCF3	P0C7M6	154 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	PPARA	Q07869	468 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	GRB10	Q13322	594 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	NAPB	Q9H115	298 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PTPRA-208	ENST00000455631	PITPNM1	O00562	1244 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	ICAM1	P05362	532 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	CCDC96	Q2M329	555 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	RAD50	Q92878	1312 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	PTPRS	Q13332	1948 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	TSPY2	A6NKD2	308 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	BFSP2	Q13515	415 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	SPRED2	Q7Z698	418 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	27.49	■■□□□ 1.99	1e-7	■■■■□ 24.1
PTPRA-208	ENST00000455631	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	TET1	Q8NFU7	2136 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	NFIB	O00712	420 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	NMT2	O60551	498 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	BAIAP3	O94812	1187 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	KCNJ6	P48051	423 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	PPP2R5B	Q15173	497 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	LPXN	O60711	386 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	GPR37L1	O60883	481 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	CALML3	P27482	149 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC16A2	P36021	539 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	CHMP4BP1	P59074	171 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PTPRA-208	ENST00000455631	KPNA6	O60684	536 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PTPRA-208	ENST00000455631	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	27.45	■■□□□ 1.98
PTPRA-208	ENST00000455631	PDE4D	Q08499	809 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PTPRA-208	ENST00000455631	DCAF4	Q8WV16	495 aa		27.45	■■□□□ 1.98

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