RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ASB14A6NK59 587 aa13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYCP01106 439 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COL6A1P12109 1028 aa13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSD17B4P51659 736 aa13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF207Q6ZRF8 634 aa13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARMCX2Q7L311 632 aa13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PIGSQ96S52 555 aa13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYL10Q9BUA6 226 aa13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VAT1LQ9HCJ6 419 aa13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC4A3P48751 1232 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACVR2BQ13705 512 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C8orf34Q49A92 452 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NSMFQ6X4W1 530 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NFXL1Q6ZNB6 911 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZUG5 572 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMTC3Q6ZXV5 915 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUP133Q8WUM0 1156 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBC1D5Q92609 795 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCEANC2Q96MN5 208 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa13.02□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LCTP09848 1927 aa13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBTB43O43298 467 aa13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLEKHA8P1O95397 391 aa13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEC24BO95487 1268 aa13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TFRCP02786 760 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CPA1P15085 419 aa13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CASTP20810 708 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAPT1Q6NXT6 567 aa13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNPY2Q9Y2B0 182 aa13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa13.01□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PIK3CDO00329 1044 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AKR1A1P14550 325 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NTRK3Q16288 839 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USH1GQ495M9 461 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC30A10Q6XR72 485 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BRF1Q92994 677 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IWS1Q96ST2 819 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VTA1Q9NP79 307 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COL20A1Q9P218 1284 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM184BQ9ULE4 1060 aa13□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTPDC1A2A3K4 754 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAMTS4O75173 837 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RXRAP19793 462 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDC27P30260 824 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IQSEC1Q6DN90 963 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MICU3Q86XE3 530 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARRDC4Q8NCT1 418 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLHDC9Q8NEP7 349 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q9Y3F1 56 aa12.99□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP290O15078 2479 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYH6P13533 1939 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FRMPD4Q14CM0 1322 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 B4DLN1 442 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNM1LO00429 736 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTAGE5O15320 804 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADCY6O43306 1168 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CALML3P27482 149 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CST5P28325 142 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNGA1P29973 690 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APOBRQ0VD83 1088 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RTN1Q16799 776 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC144BQ3MJ40 725 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NECAB2Q7Z6G3 386 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAAR1Q96RJ0 339 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 hCG_1984214I3L0E3 225 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MEIS2O14770 477 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms