RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-210	ENST00000440825	GJA9	P57773	515 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	RNF20	Q5VTR2	975 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	PRO3102	Q9H379	93 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	LY9	Q9HBG7	655 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	SMPD1	P17405	629 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	BEX3	Q00994	111 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	TROAP	Q12815	778 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	TLK2	Q86UE8	772 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	MORC4	Q8TE76	937 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	GDF15	Q99988	308 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	AMN	Q9BXJ7	453 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	ZBTB5	O15062	677 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	PIGS	Q96S52	555 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	CCDC69	A6NI79	296 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	CFB	P00751	764 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	ASGR1	P07306	291 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	SNX17	Q15036	470 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	RGS22	Q8NE09	1264 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	DNER	Q8NFT8	737 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC34A2	O95436	690 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	TLE2	Q04725	743 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM87B	Q96K49	555 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825		B4DLN1	442 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	MTMR8	Q96EF0	704 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FAAP20-210	ENST00000440825	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	COL20A1	Q9P218	1284 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	CYTH3	O43739	400 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	DDAH1	O94760	285 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	RXRA	P19793	462 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	MTA3	Q9BTC8	594 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	CTAGE5	O15320	804 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	KIF5B	P33176	963 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	BMP8B	P34820	402 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	TMTC2	Q8N394	836 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	RMDN3	Q96TC7	470 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	NEK1	Q96PY6	1258 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	EDNRB	P24530	442 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825		A0A1W2PPC1	479 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	ZEB2	O60315	1214 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	CLTB	P09497	229 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	PPP2R5B	Q15173	497 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	RASEF	Q8IZ41	740 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825	ELP1	O95163	1332 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FAAP20-210	ENST00000440825		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
FAAP20-210	ENST00000440825	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		32.13	■■■□□ 2.73
FAAP20-210	ENST00000440825	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		32.13	■■■□□ 2.73
FAAP20-210	ENST00000440825	OPLAH	O14841	1288 aa		32.13	■■■□□ 2.73
FAAP20-210	ENST00000440825	LIFR	P42702	1097 aa		32.13	■■■□□ 2.73

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