RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC41Q15345 812 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 DNERQ8NFT8 737 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 EVI5O60447 810 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMA5P28066 241 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 KBTBD13C9JR72 458 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 FGD1P98174 961 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF180Q86T96 592 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 OPLAHO14841 1288 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 CFBP00751 764 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFAIP2Q03169 654 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 APOA5Q6Q788 366 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6ZUG5 572 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 MICU3Q86XE3 530 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 B4DLN1 442 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 H0YGN5 161 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCY6O43306 1168 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS6KB1P23443 525 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 VTA1Q9NP79 307 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 COL20A1Q9P218 1284 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB43O43298 467 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTS4O75173 837 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 EDNRBP24530 442 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE4DQ08499 809 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 HSD17B4P51659 736 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.42■■□□□ 1.5
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SH3BP4-204ENST00000416021 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.42■■□□□ 1.5
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SH3BP4-204ENST00000416021 RMDN3Q96TC7 470 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SPC25Q9HBM1 224 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SMPD1P17405 629 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
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SH3BP4-204ENST00000416021 APOBRQ0VD83 1088 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXL16Q8N461 479 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 BRF1Q92994 677 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF24Q9UPV7 400 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR2MP0CAP2 368 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNA10Q16322 511 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 RTN1Q16799 776 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 RUFY3Q7L099 469 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 IWS1Q96ST2 819 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-204ENST00000416021 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 MYADML2A6NDP7 307 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 GNASQ5JWF2 1037 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.39■■□□□ 1.49
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