RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412425.1

RAB6C-AS1-201, RAB6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB6C-AS1, Length 2,454 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 COG1Q8WTW3 980 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DHX58Q96C10 678 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RMND1Q9NWS8 449 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KLF15Q9UIH9 416 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRC1O43663 620 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MTA2O94776 668 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GSTA2P09210 222 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HALP42357 657 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DDB1Q16531 1140 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CAMK4Q16566 473 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CABP7Q86V35 215 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LINS1Q8NG48 757 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SYT15Q9BQS2 421 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TNNQ9UQP3 1299 aa8.06□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TCHHQ07283 1943 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LGR5O75473 907 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KRT14P02533 472 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NEK4P51957 841 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GPSM2P81274 684 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TAF11Q15544 211 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ANO7Q6IWH7 933 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HAUS7Q99871 368 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAFFQ9ULX9 164 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NRAPQ86VF7 1730 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CYTH3O43739 400 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SKIP12755 728 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCNCP24863 283 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GSTT1P30711 240 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATL3Q6DD88 541 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AGAP11Q8TF27 550 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IFT43Q96FT9 208 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SPATA17Q96L03 361 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 WDR24Q96S15 920 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ABCA3Q99758 1704 aa8.05□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FAM107AO95990 144 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GSTT2P0CG29 244 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GSTT2BP0CG30 244 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GHRP10912 638 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ALADP13716 330 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KRT9P35527 623 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SLC16A2P36021 539 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CFAP100Q494V2 611 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 C4orf46Q504U0 113 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RNF220Q5VTB9 566 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ALS2CLQ60I27 953 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GIPC2Q8TF65 315 aa8.04□□□□□ -1.12
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IFT81Q8WYA0 676 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms