RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SMC2O95347 1197 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 VIL1P09327 827 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 BMP6P22004 513 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJB2P25686 324 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC1A4P43007 532 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ICA1Q05084 483 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NCAPHQ15003 741 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCB5Q2M3G0 1257 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SLFN13Q68D06 897 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NIM1KQ8IY84 436 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TBCKQ8TEA7 893 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC102AQ96A19 550 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PAGE5Q96GU1 130 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 VEZTQ9HBM0 779 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM260Q9NX78 707 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PIM2Q9P1W9 311 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PP2D1A8MPX8 630 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ENTPD3O75355 529 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 GH2P01242 217 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TPM3P06753 285 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 IQUBQ8NA54 791 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PLIN2Q99541 437 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 IFNKQ9P0W0 207 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NYAP2Q9P242 653 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNRF3Q9ULT6 936 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 F5H6K3 240 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 IKBKBO14920 756 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP1A3P13637 1013 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 COL9A1P20849 921 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 LONP1P36776 959 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TXLNAP40222 546 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 UBA7P41226 1012 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCY7P51828 1080 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 JAG1P78504 1218 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MYL5Q02045 173 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 KLRC3Q07444 240 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 LRMPQ12912 555 aa4.51□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL10Q6JEL2 608 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM179Q6ZVK1 233 aa4.51□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SULF1Q8IWU6 871 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 GMLQ99445 158 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PYCARDQ9ULZ3 195 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SERPINC1P01008 464 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 POLD1P28340 1107 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TNNI2P48788 182 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PSEN2P49810 448 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SNAP25P60880 206 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 FANCCQ00597 558 aa4.5□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 MORC3Q14149 939 aa4.5□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2SQ16763 222 aa4.5□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NT5DC1Q5TFE4 455 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MLKLQ8NB16 471 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 JDP2Q8WYK2 163 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MKL1Q969V6 931 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 FANCLQ9NW38 375 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 QSER1Q2KHR3 1735 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ESYT2A0FGR8 921 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB5O15062 677 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SPTLC1O15269 473 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NEMFO60524 1076 aa4.5□□□□□ -1.69
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