RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF20Q5VTR2 975 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D5Q92609 795 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MTMR8Q96EF0 704 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 GDF15Q99988 308 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MTA3Q9BTC8 594 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 AMNQ9BXJ7 453 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 SMPD1P17405 629 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 CST5P28325 142 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM87BQ96K49 555 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB5O15062 677 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 PTGS1P23219 599 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE4DQ08499 809 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 GNASQ5JWF2 1037 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 HOMER1Q86YM7 354 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 DNERQ8NFT8 737 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MYL10Q9BUA6 226 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MAF1Q9H063 256 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 CTAGE5O15320 804 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TLK2Q86UE8 772 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PIGSQ96S52 555 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 B4DLN1 442 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CYTH3O43739 400 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 DDAH1O94760 285 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC34A2O95436 690 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 ASGR1P07306 291 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 EDNRBP24530 442 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 BEX3Q00994 111 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TMTC2Q8N394 836 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 COL20A1Q9P218 1284 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC69A6NI79 296 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 BMP8BP34820 402 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 NKX3-2P78367 333 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TLE2Q04725 743 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K14Q99558 947 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 LTBP2Q14767 1821 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PPC1 479 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 OPLAHO14841 1288 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CFBP00751 764 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF5BP33176 963 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 LIFRP42702 1097 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 RASEFQ8IZ41 740 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 NEK1Q96PY6 1258 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 RMDN3Q96TC7 470 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 Q9Y3F1 56 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 ELP1O95163 1332 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 RXRAP19793 462 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAF1Q13077 416 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD39-201ENST00000393537 HSD17B4P51659 736 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 SCFD2Q8WU76 684 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD39-201ENST00000393537 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms