RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 STAMQ92783 540 aa17.41■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 AS3MTQ9HBK9 375 aa17.41■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa17.41■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 LAD1O00515 517 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 FLOT1O75955 427 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 CASP1P29466 404 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 PRPHP41219 470 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 AFMP43652 599 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 USP14P54578 494 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 MAP3K9P80192 1104 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 KARSQ15046 597 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 STX1AQ16623 288 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 FCHSD1Q86WN1 690 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 CPXCR1Q8N123 301 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 FAM200AQ8TCP9 573 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 WNK4Q96J92 1243 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 PLIN2Q99541 437 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa17.4■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF165P49910 485 aa17.39■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 VGLL4Q14135 290 aa17.39■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 CALCRLQ16602 461 aa17.39■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 TUBE1Q9UJT0 475 aa17.39■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa17.39■□□□□ 0.38
CASQ1-201ENST00000368078 AP5Z1O43299 807 aa17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 E2F4Q16254 413 aa17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 UVSSAQ2YD98 709 aa17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PPP4R3AQ6IN85 833 aa17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CRYGNQ8WXF5 182 aa17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PAGE5Q96GU1 130 aa17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ANO10Q9NW15 660 aa17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PARP14Q460N5 1801 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SPDYE3A6NKU9 549 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SLFN14P0C7P3 912 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 POTEIP0CG38 1075 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 POTEJP0CG39 1038 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 POSTNQ15063 836 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 DPCR1Q3MIW9 517 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 HAS1Q92839 578 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CDCA5Q96FF9 252 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CCPG1Q9ULG6 757 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 RLFQ13129 1914 aa17.38■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ICAM1P05362 532 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 USP11P51784 963 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 NLRP12P59046 1061 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP4P98171 946 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 AP3B2Q13367 1082 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 IQCB1Q15051 598 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC15Q8TF66 581 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PIK3CDO00329 1044 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 UBA7P41226 1012 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PDXDC2PQ6P474 469 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CEP57L1Q8IYX8 460 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ATG4CQ96DT6 458 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MTRQ99707 1265 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 USP25Q9UHP3 1055 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 OTOFQ9HC10 1997 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C19orf81C9J6K1 198 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 POLR2MP0CAP2 368 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ALAS1P13196 640 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 BMP6P22004 513 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 UBXN2AP68543 259 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PLCB2Q00722 1185 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 KANK3Q6NY19 840 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 IGSF22Q8N9C0 903 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 IQUBQ8NA54 791 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ELP3Q9H9T3 547 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 HOMER2Q9NSB8 354 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SCN4AP35499 1836 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 NFIBO00712 420 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CYP3A7P24462 503 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SARSP49591 514 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TRAF1Q13077 416 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 NAALADL2Q58DX5 795 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MUM1L1Q5H9M0 696 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CABP7Q86V35 215 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC4DQ8WXI8 215 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C12orf42Q96LP6 360 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms