RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 USP17L6PQ6QN14 398 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC186Q7Z3E2 898 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 KCNF1Q9H3M0 494 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 CUEDC2Q9H467 287 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 TECP42680 631 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 SAMD7Q7Z3H4 446 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 BLZF1Q9H2G9 400 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 TXKP42681 527 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP30.26■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 CUL4BQ13620 913 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 ANO3Q9BYT9 981 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 MAGEF1Q9HAY2 307 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 NRBP1Q9UHY1 535 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 PHF20L1A8MW92 1017 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 MEIS2O14770 477 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM266Q2M3C6 531 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 IFNKQ9P0W0 207 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 FANCCQ00597 558 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 USH1GQ495M9 461 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 SBF1O95248 1867 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 PLA2G6O60733 806 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 MYL1P05976 194 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 TRAF1Q13077 416 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 FANCLQ9NW38 375 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 RMND1Q9NWS8 449 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 ATP1A3P13637 1013 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 CHURC1Q8WUH1 139 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 RAB34Q9BZG1 259 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 KBTBD4Q9NVX7 518 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 HACL1Q9UJ83 578 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 PLCG1P19174 1290 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 USP11P51784 963 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC144BQ3MJ40 725 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 PDIA5Q14554 519 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 FAM160B2Q86V87 743 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 GINM1Q9NU53 330 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 LRWD1Q9UFC0 647 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 RPN1P04843 607 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 TEX2Q8IWB9 1127 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 PLIN2Q99541 437 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 FOSP01100 380 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 CD44P16070 742 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 MOXD1Q6UVY6 613 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC15Q8TF66 581 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 CALML4Q96GE6 196 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 MED15Q96RN5 788 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 CBFA2T2O43439 604 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 MBOAT7Q96N66 472 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXD8-201ENST00000313173 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 OPLAHO14841 1288 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 CYP3A7P24462 503 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 CRYGNQ8WXF5 182 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 HAS1Q92839 578 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB129Q9H1M3 183 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 RNF181Q9P0P0 153 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 FEM1BQ9UK73 627 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF18P17022 549 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 SEMA3FQ13275 785 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF341Q9BYN7 854 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINC1P01008 464 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 FEZ1Q99689 392 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 IMPACTQ9P2X3 320 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 SPDYE3A6NKU9 549 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 H7C1D1 291 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 PIK3CDO00329 1044 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP4P98171 946 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 KCNB1Q14721 858 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 KIFC2Q96AC6 838 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 UBASH3AP57075 661 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA1Q5VX52 437 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 GPC2Q8N158 579 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 POTEMA6NI47 508 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 SREBF1P36956 1147 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 GRB10Q13322 594 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL10Q6JEL2 608 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 STK17AQ9UEE5 414 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXD8-201ENST00000313173 PYCARDQ9ULZ3 195 aa30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms