RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264694.12

SNX25-201, Transcript of sorting nexin 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SNX25, Length 3,264 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25-201ENST00000264694 MIIPQ5JXC2 388 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 ALS2CLQ60I27 953 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 EMBQ6PCB8 327 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 P2RX5Q93086 422 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 ZNF233A6NK53 670 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 FNTAP49354 379 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 MTA3Q9BTC8 594 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 DISP2A7MBM2 1401 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 USP8P40818 1118 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 RASSF7Q02833 373 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 NAA35Q5VZE5 725 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 CABS1Q96KC9 395 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 RHOBTB3O94955 611 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 ASIC1P78348 528 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 RRAGAQ7L523 313 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 MTMR8Q96EF0 704 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 MYH10P35580 1976 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 MAGEA1P43355 309 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 INF2Q27J81 1249 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 STARD3NLO95772 234 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 CCNE1P24864 410 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 TRAPPC10P48553 1259 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 IFT88Q13099 833 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 KCNB1Q14721 858 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 BLIDQ8IZY5 108 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 RETREG2Q8NC44 543 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 TLR10Q9BXR5 811 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 USP17L12C9JPN9 530 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 USP17L21D6R901 530 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 PLCG1P19174 1290 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX25-201ENST00000264694 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.71□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 LRRC53A6NM62 1247 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 NR1D1P20393 614 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 MMP14P50281 582 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 CAVIN3Q969G5 261 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 FTCDO95954 541 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 CALM1P0DP23 149 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 CALM2P0DP24 149 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 CALM3P0DP25 149 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 KRT12Q99456 494 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 BACH1O14867 736 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 SLC1A4P43007 532 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 GYG1P46976 350 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 PIGBQ92521 554 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 EPN3Q9H201 632 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 E7EVH7 732 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 ATP6V1AP38606 617 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 IFT20Q8IY31 132 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 PPP1R37O75864 691 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 DDAH1O94760 285 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 CYP2D6P10635 497 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 PTGISQ16647 500 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 IQCKQ8N0W5 287 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX25-201ENST00000264694 FSBPO95073 299 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms