RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 TRAF5O00463 557 aa20.54■□□□□ 0.88
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LRP3-201ENST00000253193 ZNF185O15231 689 aa20.54■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 GRIK5Q16478 980 aa20.54■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 POTEDQ86YR6 584 aa20.54■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 MMS19Q96T76 1030 aa20.54■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 TRIM9Q9C026 710 aa20.54■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 STXBP3O00186 592 aa20.54■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 GALNT17Q6IS24 598 aa20.54■□□□□ 0.88
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LRP3-201ENST00000253193 USP17L5A8MUK1 530 aa20.53■□□□□ 0.88
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LRP3-201ENST00000253193 MCM3P25205 808 aa20.53■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.53■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.53■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 CEP95Q96GE4 821 aa20.53■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.53■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.53■□□□□ 0.88
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LRP3-201ENST00000253193 C4BP0C0L5 1744 aa20.53■□□□□ 0.88
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LRP3-201ENST00000253193 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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LRP3-201ENST00000253193 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.52■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.52■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 LAD1O00515 517 aa20.52■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 ADCY7P51828 1080 aa20.52■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 TUBBP07437 444 aa20.51■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 FGRP09769 529 aa20.51■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 KCNB1Q14721 858 aa20.51■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 AK8Q96MA6 479 aa20.51■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 GGA1Q9UJY5 639 aa20.51■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 MYH7P12883 1935 aa20.51■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 TTI2Q6NXR4 508 aa20.5■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 SLF2Q8IX21 1173 aa20.5■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.5■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.5■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 A0A1W2PQC6 194 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 MOCS3O95396 460 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 TDP2O95551 362 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 PLCG2P16885 1265 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 MYO1CO00159 1063 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 MYL1P05976 194 aa20.49■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 HERVK_113P62684 666 aa20.49■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.48■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.48■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 SLC7A5Q01650 507 aa20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 RASSF7Q02833 373 aa20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 CENPHQ9H3R5 247 aa20.47■□□□□ 0.87
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