RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 AMNQ9BXJ7 453 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CPVLQ9H3G5 476 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PTGER2P43116 358 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TERF1P54274 439 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 RHBDL3P58872 404 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PDE4DQ08499 809 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC8AQ8IWT6 810 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CHURC1Q8WUH1 139 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 STK24Q9Y6E0 443 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TECP42680 631 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 SP4Q02446 784 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CEP135Q66GS9 1140 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 FBXO11Q86XK2 927 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 VPS33BQ9H267 617 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 STXBP3O00186 592 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ZBTB5O15062 677 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ENTPD3O75355 529 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 GDF11O95390 407 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PDHBP11177 359 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 SLC16A2P36021 539 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ERICH4A6NGS2 130 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM232C9JQI7 657 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF543Q08ER8 600 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 NELFBQ8WX92 580 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 DISC1Q9NRI5 854 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 BMP3P12645 472 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PRPHP41219 470 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 LRMPQ12912 555 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 MRIQ9BWK5 157 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 EHD4Q9H223 541 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 USH1GQ495M9 461 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CPXCR1Q8N123 301 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 MTFR1LQ9H019 292 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 NYAP2Q9P242 653 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ESYT2A0FGR8 921 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 DYNC1I1O14576 645 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TGFB2P61812 414 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 FUT2Q10981 343 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 SEPT2Q15019 361 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PARP14Q460N5 1801 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CNGA4Q8IV77 575 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 HOOK2Q96ED9 719 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 MYH4Q9Y623 1939 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 GH2P01242 217 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM14Q14142 442 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 CDC25AP30304 524 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 GINS2Q9Y248 185 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PHIPQ8WWQ0 1821 aa11.85□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.85□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 FAM196BA6NMK8 535 aa11.85□□□□□ -0.51
PRRX1-201ENST00000239461 PRR29P0C7W0 189 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms