RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 MYBL2P10244 700 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 TCP1P17987 556 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CCNE1P24864 410 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF5BP33176 963 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 EPHB4P54760 987 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CREG2Q8IUH2 290 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 BLIDQ8IZY5 108 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CERKQ8TCT0 537 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CAPS2Q9BXY5 557 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCF2Q9UG63 623 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 LAMB1P07942 1786 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 B4DLN1 442 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 HSPA1LP34931 641 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 RFC4P35249 363 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 NNTQ13423 1086 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 KAT14Q9H8E8 782 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 SHTN1A0MZ66 631 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 RCCD1A6NED2 376 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 LCA5LO95447 670 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 GUCY2CP25092 1073 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 PRPHP41219 470 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 PDE4CQ08493 712 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 GALNT17Q6IS24 598 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 SKOR1P84550 965 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 P2RX5Q93086 422 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CAVIN3Q969G5 261 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC42Q96M95 316 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 RASSF10A6NK89 507 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 POTEDQ86YR6 584 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 DEF6Q9H4E7 631 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 MYH1P12882 1939 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 UBA7P41226 1012 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 AK8Q96MA6 479 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 SH2D4AQ9H788 454 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 C2orf54Q08AI8 447 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 ALS2CR12Q96Q35 445 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF185O15231 689 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 APBA1Q02410 837 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 SPATA4Q8NEY3 305 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 HYOU1Q9Y4L1 999 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCB11O95342 1321 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 ZMYND10O75800 440 aa25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 RNF14Q9UBS8 474 aa25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 TFR2Q9UP52 801 aa25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54-201ENST00000215941 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.39■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 TSKSQ9UJT2 592 aa25.39■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 ERLIN2O94905 339 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 ZBTB9Q96C00 473 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 STIM2Q9P246 746 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM169AQ9Y6X4 670 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 GRIN2DO15399 1336 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 M0R2N6 131 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC96Q2M329 555 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 MIIPQ5JXC2 388 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 KLRK1P26718 216 aa25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 TM4SF1P30408 202 aa25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 USP8P40818 1118 aa25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 CCT5P48643 541 aa25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54-201ENST00000215941 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms