RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088356.9

Usf3-201, Transcript of Gene model 608, (NCBI), mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Usf3, Length 757 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3-201ENSMUST00000088356 DlatQ8BMF4 642 aa20.38■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Alx1Q8C8B0 326 aa20.38■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Man1b1A2AJ15 658 aa20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 MccE9PWI3 1003 aa20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rps6P62754 249 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Skap1Q3UUV5 355 aa20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 A1cfQ5YD48 595 aa20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Avpr1aQ62463 423 aa20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Armc6Q8BNU0 468 aa20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 ClmnQ8C5W0 1052 aa20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Oxnad1Q8VE38 311 aa20.37■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fam124aD3Z5V4 536 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Hmox1P14901 289 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Crtc1Q68ED7 630 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Htatsf1Q8BGC0 757 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ccdc15Q8C9M2 810 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Iqsec1Q8R0S2 961 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 AdpgkQ8VDL4 496 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trpv6Q91WD2 767 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Grin3bQ91ZU9 1003 aa20.36■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Col4a4Q9QZR9 1682 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dnaaf5B9EJR8 853 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kifap3P70188 793 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Bmp1P98063 991 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Hand2Q61039 217 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 LppQ8BFW7 613 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 MafaQ8CF90 359 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fgd4Q91ZT5 766 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Me2Q99KE1 589 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 CenpsQ9D084 142 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trpm5Q9JJH7 1158 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Unc80Q8BLN6 3261 aa20.35■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Klhl34A2AI76 644 aa20.34■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cd3dP04235 173 aa20.34■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa20.34■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 QarsQ8BML9 775 aa20.34■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Foxe1Q8R2I0 371 aa20.34■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Lrrc46Q9DAP0 323 aa20.34■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa20.34■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 JcadQ5DTX6 1320 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ccdc146E9Q9F7 977 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ptpn11P35235 597 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ces3aQ63880 571 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tmc8Q7TN58 722 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Map1sQ8C052 973 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fermt2Q8CIB5 680 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ces3bQ8VCU1 571 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Olfr1494Q8VGP8 315 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Erc1Q99MI1 1120 aa20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm4788E9Q8B5 879 aa20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trmt13Q8BYH3 481 aa20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Agbl3Q8CDP0 1006 aa20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Hdhd5Q91WM2 419 aa20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Armcx1Q9CX83 456 aa20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa20.32■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ect2lA0A140LIP2 953 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tbkbp1A2A9T0 611 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Stra6O70491 670 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Stx8O88983 236 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 CatspereP0DP43 985 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Bmp8aP34821 399 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Lrrc55Q3UY51 311 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ccdc125Q5U465 500 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Susd6Q8BGE4 302 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Aldh8a1Q8BH00 487 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gfra4Q9JJT2 260 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Myh8P13542 1937 aa20.31■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gcnt4E9Q649 455 aa20.3■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ca3P16015 260 aa20.3■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Aco1P28271 889 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tmem199Q5SYH2 208 aa20.3■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa20.3■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mad2l2Q9D752 211 aa20.3■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Limd1Q9QXD8 668 aa20.3■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa20.29■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm3383J3QQ59 259 aa20.29■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Vwa3bJ9JI28 736 aa20.29■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 P04214 136 aa20.29■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Syt2P46097 422 aa20.29■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Arhgap1Q5FWK3 439 aa20.29■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ptger2Q62053 362 aa20.29■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Depdc1aQ8CIG0 804 aa20.29■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 ArcQ9WV31 396 aa20.29■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Irs2P81122 1321 aa20.28■□□□□ 0.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Wdr5P61965 334 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.3 ms