RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C MRX6P48564 524 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C COG4Q06096 861 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ECM30Q06673 1274 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RTT109Q07794 436 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YEH2Q07950 538 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C CTI6Q08923 506 aa1.87□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ARG81P05085 880 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SNF3P10870 884 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C HSC82P15108 705 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C IMG1P25626 169 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C CMK1P27466 446 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PEP3P27801 918 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SYN8P31377 255 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ACH1P32316 526 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C UBP11P36026 717 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YBR225WP38321 900 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YTA12P40341 825 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YJL068CP40363 299 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PTR3P43606 678 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C FAR3P46671 204 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPS10BP46784 105 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PYK2P52489 506 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ERG26P53199 349 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YGR127WP53275 312 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RSM23Q01163 450 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YEH1Q07804 573 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RCN2Q12044 265 aa1.86□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C GCN4P03069 281 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C EST1P17214 699 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPS2P25443 254 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PUP3P25451 205 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SSE2P32590 693 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YBR144CP34215 104 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ICS2P38284 255 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C CCT6P39079 546 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ERP2P39704 215 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C NPR2P39923 615 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C NDE1P40215 560 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ARE2P53629 642 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C VPS75P53853 264 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TDA7P53882 636 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MSS11Q03825 758 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RBA50Q04418 439 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MFB1Q04922 465 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C THI20Q08224 551 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SDH5Q08230 162 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RDR1Q08904 546 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YPT6Q99260 215 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SGS1P35187 1447 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C PUT2P07275 575 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C CBS1P14066 229 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TYR1P20049 452 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C BOS1P25385 244 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SNC1P31109 117 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MTR2P34232 184 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C NUP133P36161 1157 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ROT2P38138 954 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C REG2P38232 338 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TIF5P38431 405 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data1.85□□□□□ -2.11not detected
HDA3YPR179C SPG5P42933 373 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C APT1P49435 187 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RBG2P53295 368 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TIM10P87108 93 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YLL056CQ12177 298 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YJR112W-AQ3E743 109 aa1.85□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C CYB2P00175 591 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MRP13P12686 339 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MCM4P30665 933 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ATS1P31386 333 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TIF3P34167 436 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YKL100CP34248 587 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPL32P38061 130 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C SRO77P38163 1010 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ALG5P40350 334 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ESL1P40456 1118 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPR2P40571 144 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YPI1P43587 155 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RTT101P47050 842 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C VID30P53076 958 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C IPI3P53877 555 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C MSC1Q03104 513 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C YMR087WQ04299 284 aa1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C TSR2Q06672 205 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C ETT1Q08421 412 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
HDA3YPR179C GDH1P07262 454 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C MRP7P12687 371 aa1.83□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C ART10P18634 518 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C SEF1P34228 1148 aa1.83□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C TCD2P36101 447 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C RPH1P39956 796 aa1.83□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C DOT5P40553 215 aa1.83□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YJL213WP40896 331 aa1.83□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C IKS1P47042 667 aa1.83□□□□□ -2.12
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