RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PFA4	YOL003C	PDR3	P33200	976 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YBL029W	P38201	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	ANS1	P38832	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YIL169C	P40442	995 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	EFM6	P53970	246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	NUP100	Q02629	959 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	NMD4	Q12129	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	PUT2	P07275	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	SAN1	P22470	610 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	MGR1	P25573	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	SYN8	P31377	255 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	RKM3	P38222	552 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	DBP8	P38719	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	FLC2	P39719	783 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	RGI2	P40188	164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	GRC3	Q07845	632 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	RAD9	P14737	1309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	ARG81	P05085	880 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	AAC3	P18238	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YND1	P40009	630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	TMA108	P40462	946 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	FET5	P43561	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	SOL4	P53315	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	NGL3	Q03210	505 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	TEN1	Q07921	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	HUA2	Q12134	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	SNF3	P10870	884 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	POL4	P25615	582 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YIH1	P25637	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	IMP2'	P32351	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YAP3	P38749	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	CCT6	P39079	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	FAR3	P46671	204 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	SMA1	Q02651	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YML037C	Q03703	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	FMP42	Q04991	504 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	ENT1	Q12518	454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	CDC23	P16522	626 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	HNM1	P19807	563 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	NUP133	P36161	1157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YUR1	P26725	428 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	RAD24	P32641	659 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	SPC34	P36131	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	YGR127W	P53275	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	RSM23	Q01163	450 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	RDR1	Q08904	546 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	BSC1	Q12140	328 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PFA4	YOL003C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	BOS1	P25385	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	IMG1	P25626	169 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	YBR144C	P34215	104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	YKL100C	P34248	587 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	ERG7	P38604	731 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	ATG27	P46989	271 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	MSC1	Q03104	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	GRS2	Q06817	618 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	YEH1	Q07804	573 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	TAH18	Q12181	623 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	RRI2	Q12348	645 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	SGF29	P25554	259 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	SNC1	P31109	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	SWE1	P32944	819 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	PHD1	P36093	366 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	LAG1	P38703	411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	YIR014W	P40570	242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	PTR3	P43606	678 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	GUF1	P46943	645 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PFA4	YOL003C	LCL3	P53153	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms