RNA–Protein interactions for RNA: YHR122W

CIA2, Transcript of Component of cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene CIA2, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIA2	YHR122W	PDX1	P16451	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	KAR3	P17119	729 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	CKA2	P19454	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	RPC53	P25441	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	TMT1	P32643	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	CSE2	P33308	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	GLG1	P36143	616 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YPT10	P38146	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MUM2	P38236	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	RGI2	P40188	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	LAM5	P43560	674 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ALT2	P52892	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	LCL3	P53153	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YML119W	Q03208	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	CRN1	Q06440	651 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	TLG2	Q08144	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	RTN2	Q12443	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	AMD2	P22580	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ADK2	P26364	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MRPL9	P31334	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	COT1	P32798	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SRO77	P38163	1010 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	OPT1	P40897	799 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MSE1	P48525	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	CUL3	P53202	744 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YML053C	Q04978	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SHS1	Q07657	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	GLN3	P18494	730 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	CTS1	P29029	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YSC83	P32792	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ORC2	P32833	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	AGP2	P38090	596 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	UBP13	P38187	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SLX1	P38324	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YHL026C	P38740	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ORC5	P50874	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YML6	P51998	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	COG2	P53271	262 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	AAT1	Q01802	451 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	VTC3	Q02725	835 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SWA2	Q06677	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	PSR1	Q07800	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	BAG7	Q12128	409 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	COX4	P04037	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	DPH2	P32461	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	PEX2	P32800	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	HES1	P35843	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	HEL1	P36113	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YER130C	P39959	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
CIA2	YHR122W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	COQ6	P53318	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	HST1	P53685	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YNL092W	P53934	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YAT1	P80235	687 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	RCF1	Q03713	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YEH1	Q07804	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
CIA2	YHR122W	ISA2	Q12425	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	LAA1	P39526	2014 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	VMA16	P23968	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	LAC1	P28496	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	PRR1	P28708	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	GDA1	P32621	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	GCS1	P35197	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YHR131C	P38835	850 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	BDH2	P39713	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YEL057C	P39983	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	BUR6	P40096	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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