RNA–Protein interactions for RNA: YGR209C

TRX2, Transcript of Cytoplasmic thioredoxin isoenzyme, yeast

Gene TRX2, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRX2	YGR209C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ICT1	Q12385	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	FRT1	Q99332	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SPT3	P06844	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	COS2	P0CX12	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	COS3	P0CX13	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	CNA1	P23287	553 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	PHO3	P24031	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	DMC1	P25453	334 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	CIN8	P27895	1000 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	BRF1	P29056	596 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YKL100C	P34248	587 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SKG1	P36169	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	KTR4	P38131	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	TDP1	P38319	544 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	EFM1	P38732	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YIR007W	P40566	764 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	GCD10	P41814	478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	IME4	P41833	600 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	COS4	P43542	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	COG1	P53079	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	UGO1	Q03327	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	GOT1	Q03554	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RAD30	Q04049	632 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	NSE1	Q07913	336 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	PEX11	Q12462	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MRP13	P12686	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RSR1	P13856	272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	PMA2	P19657	947 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	CMK2	P22517	447 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RBK1	P25332	333 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	POL4	P25615	582 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	STE14	P32584	239 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	PEX6	P33760	1030 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	GCS1	P35197	352 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	THI80	P35202	319 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SPC42	P36094	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ECM4	P36156	370 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SOH1	P38633	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ARP1	P38696	384 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	GOS1	P38736	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
TRX2	YGR209C	GIP4	P39732	760 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	AYR1	P40471	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	GTS1	P40956	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	FKH2	P41813	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	GTO1	P48239	356 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MRK1	P50873	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RMR1	P53060	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SCW11	P53189	542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	COQ6	P53318	479 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	REG1	Q00816	1014 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	TOF2	Q02208	771 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SRL4	Q03085	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RPN4	Q03465	531 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ECM11	Q04110	302 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MRX10	Q05648	414 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ENT2	Q05785	613 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RIF2	Q06208	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MNL2	Q12205	849 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SEM1	O94742	89 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SUC2	P00724	532 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	COR1	P07256	457 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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