RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W CPA1P07258 411 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SWI5P08153 709 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W FUM1P08417 488 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W MET8P15807 274 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W DBR1P24309 405 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YPT52P36018 234 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SOL2P37262 315 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NPT1P39683 429 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W MET18P40469 1032 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NBP35P52920 328 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W REX2P54964 269 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W RSC3Q06639 885 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W CDA1Q06702 301 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W ATG10Q07879 167 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YLR049CQ12110 428 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W Q0182Q9ZZW1 134 aa8.72□□□□□ -1.01
DDI1YER143W CDC21P06785 304 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W PWP1P21304 576 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W VPS34P22543 875 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W DGR2P32330 852 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W TAE1P38340 232 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YHR078WP38799 552 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W UBA4P38820 440 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SCS2P40075 244 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W FKH2P41813 862 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YGL108CP53139 140 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W HST3P53687 447 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CCE1Q03702 353 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ATG34Q12292 412 aa8.71□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SEM1O94742 89 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W TRP3P00937 484 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YCK2P23292 546 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W RSC6P25632 483 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SSE1P32589 693 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W FZO1P38297 855 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W FTH1P38310 465 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W EMP65P40085 556 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SEC27P41811 889 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W GCD10P41814 478 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W BCH1Q05029 724 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W HPF1Q05164 967 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YLR413WQ06689 675 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MMP1Q12372 583 aa8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
DDI1YER143W INH1P01097 85 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W COS2P0CX12 379 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W COS3P0CX13 379 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SPS22P25380 463 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W STE14P32584 239 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W SDH3P33421 198 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W RMA1P36001 430 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YKL151CP36059 337 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YBL029WP38201 376 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W TRM5P38793 499 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W UTP9P38882 575 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W PIK1P39104 1066 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ECM1P39715 212 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YEN1P40028 759 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ALG5P40350 334 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W RLP7P40693 322 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W COS4P43542 379 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W PTR3P43606 678 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W NAS6P50086 228 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W IMA1P53051 589 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W AAT1Q01802 451 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W EMI1Q04406 187 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W RAD34Q06665 692 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MCH5Q08777 521 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MCD1Q12158 566 aa8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDI1YER143W TUB1P09733 447 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YKR104WP0CE69 306 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CLN2P20438 545 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W OCA4P25366 362 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W PHO91P27514 894 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CIN8P27895 1000 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ATP11P32453 318 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CSE1P33307 960 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YKL100CP34248 587 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W FRE2P36033 711 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CAF4P36130 643 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W RPF2P36160 344 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CCT6P39079 546 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YER034WP40022 185 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W IAH1P41734 238 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W CCT7P42943 550 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W NNF1P47149 201 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W RPA14P50106 137 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W YPT32P51996 222 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W COG2P53271 262 aa8.68□□□□□ -1.02
DDI1YER143W ZRG17P53735 605 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms