RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TSHZ3Q63HK5 1081 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CHURC1Q8WUH1 139 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SOWAHBA6NEL2 793 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R2C6 588 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ALAS1P13196 640 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE4BQ07343 736 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM160B2Q86V87 743 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MICALL1Q8N3F8 863 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC1A4P43007 532 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 NKX3-2P78367 333 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 EEPD1Q7L9B9 569 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC43A3Q8NBI5 491 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 NEDD1Q8NHV4 660 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TRERF1Q96PN7 1200 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 NACAP1Q9BZK3 213 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBBXA8MT70 800 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGS1P23219 599 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TFAP4Q01664 338 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TKFCQ3LXA3 575 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNL3Q8IZI9 196 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 STAG1Q8WVM7 1258 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPV6Q9H1D0 765 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-217ENST00000629983 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SMPD1P17405 629 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PLIN4Q96Q06 1357 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MCCP23508 829 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 RABGGTBP53611 331 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAP25P60880 206 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMC6P62333 389 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2R2DQ66LE6 453 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PDGFCQ9NRA1 345 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MCM3APO60318 1980 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 B4GALT4O60513 344 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 GMCL1Q96IK5 515 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NAPBQ9H115 298 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF536O15090 1300 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NSMFQ6X4W1 530 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD1Q719H9 257 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MIER1Q8N108 512 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 STX8Q9UNK0 236 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR7Q9Y216 660 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIN2DO15399 1336 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH4Q9Y623 1939 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 IQSEC1Q6DN90 963 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SCLYQ96I15 445 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT8AQ9H1J5 351 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PPARAQ07869 468 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MUM1L1Q5H9M0 696 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MYOGP15173 224 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP39A1Q9NYL5 469 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CCPG1Q9ULG6 757 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TAPT1Q6NXT6 567 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 VTA1Q9NP79 307 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 Q9Y3F1 56 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPY2A6NKD2 308 aa32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM63BQ5T3F8 832 aa32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR12Q9ULL5 1215 aa32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC96Q2M329 555 aa32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RCSD1Q6JBY9 416 aa32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RASGRP2Q7LDG7 609 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 FSD1Q9BTV5 496 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RCAN3Q9UKA8 241 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G6O60733 806 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2C9P11712 490 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf194Q5TEA3 1177 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB128Q7Z7B8 93 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MYL3P08590 195 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR3EQ9NVU0 708 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CHD9Q3L8U1 2897 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO9BQ13459 2157 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TNKSO95271 1327 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PFKMP08237 780 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL4Q14679 1199 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM47CQ5HY64 1035 aa32.38■■■□□ 2.77
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