RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624951.1

CU633980.2-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CU633980.2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.2-201ENST00000624951 SLC4A3P48751 1232 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 GRB14Q14449 540 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 MORN1Q5T089 497 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 FBXO11Q86XK2 927 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PIGSQ96S52 555 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 AMNQ9BXJ7 453 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 HOMER2Q9NSB8 354 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SMCHD1A6NHR9 2005 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 HTTP42858 3142 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PFKFB2O60825 505 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ADD1P35611 737 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CCT2P78371 535 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PRKCZQ05513 592 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 FUT2Q10981 343 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 STK3Q13188 491 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 KCTD2Q14681 263 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 USH1GQ495M9 461 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 MMP19Q99542 508 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 NUDT12Q9BQG2 462 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PFASO15067 1338 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 CPLX1O14810 134 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 IFNAR1P17181 557 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 ADORA2AP29274 412 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 RGS2P41220 211 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 FLT3LGP49771 235 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 MAP2K5Q13163 448 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 IRF5Q13568 498 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 CCDC82Q8N4S0 544 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 USP6NLQ92738 828 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 GTF3C6Q969F1 213 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 APBA2Q99767 749 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 MAF1Q9H063 256 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 GJD2Q9UKL4 321 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 GABRQQ9UN88 632 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 hCG_1984214I3L0E3 225 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 CDKL5O76039 1030 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 MCM2P49736 904 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 SCRN1Q12765 414 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 NTRK3Q16288 839 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 ME3Q16798 604 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 MUM1L1Q5H9M0 696 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 RAET1EQ8TD07 263 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 CLEC4DQ8WXI8 215 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 NFIBO00712 420 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 LARGE1O95461 756 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 HOXC6P09630 235 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 DPP9Q86TI2 863 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 TRIM22Q8IYM9 498 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 RGS22Q8NE09 1264 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 DDX11Q96FC9 970 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 CYP2B6P20813 491 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PPP1R18Q6NYC8 613 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 NSMFQ6X4W1 530 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 NECAB1Q8N987 351 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PXYLP1Q8TE99 480 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 PHKBQ93100 1093 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 SLC26A6Q9BXS9 759 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 STK36Q9NRP7 1315 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633980.2-201ENST00000624951 LCTP09848 1927 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms