RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TXNRD1Q16881 649 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 KCTD16Q68DU8 428 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 P2RX5Q93086 422 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 OR52Z1P0C646 297 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TEX11Q8IYF3 940 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TRAPPC10P48553 1259 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 SNX29Q8TEQ0 813 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 SEMA3EO15041 775 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ATP1A2P50993 1020 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 RASSF7Q02833 373 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 STK4Q13043 487 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 FAM71BQ8TC56 605 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TAF4BQ92750 862 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 GNA11P29992 359 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ITPK1Q13572 414 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ODF2Q5BJF6 829 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 KRT79Q5XKE5 535 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 SHISA4Q96DD7 197 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 SHTN1A0MZ66 631 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 NCK2O43639 380 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 GUCY2FP51841 1108 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ANKRD40Q6AI12 368 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 COA7Q96BR5 231 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 EYA3Q99504 573 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa15.37■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TUBB4BP68371 445 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TBCKQ8TEA7 893 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 RAB34Q9BZG1 259 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 EHD2Q9NZN4 543 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 L1RE1Q9UN81 338 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 HSF2BPO75031 334 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 CAMTA2O94983 1202 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 C8orf74Q6P047 294 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 PDXDC2PQ6P474 469 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ADSSL1Q8N142 457 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.36■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TUBBP07437 444 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 GGCXP38435 758 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.055e-6■■■■□ 19.6
HPS1-215ENST00000613394 IL17AQ16552 155 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 PIGSQ96S52 555 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 MTRQ99707 1265 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 CALCRLQ16602 461 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 KLHL7Q8IXQ5 586 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TMEM260Q9NX78 707 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 NTSR2O95665 410 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 LDHCP07864 332 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 CCT5P48643 541 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 NUP58Q9BVL2 599 aa15.35■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 RIMBP2O15034 1052 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 CCNE1P24864 410 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TMC4Q7Z404 712 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 NEK8Q86SG6 692 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 GJA10Q969M2 543 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 SPAG5Q96R06 1193 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 POTEMA6NI47 508 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 KIAA0754O94854 1291 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ARHGAP25P42331 645 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ZBED6P86452 979 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HPS1-215ENST00000613394 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms