RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 PFKMP08237 780 aa22.75■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 CYP2C18P33260 490 aa22.75■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 PIEZO1Q92508 2521 aa22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 MYADML2A6NDP7 307 aa22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 PRDM1O75626 825 aa22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 PPARAQ07869 468 aa22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO40Q9UH90 709 aa22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 ZEB2O60315 1214 aa22.73■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 NKX3-2P78367 333 aa22.73■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 TFF2Q03403 129 aa22.73■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 PDE4BQ07343 736 aa22.73■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.73■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.73■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.73■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.72■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 RAD21O60216 631 aa22.72■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 GPR37L1O60883 481 aa22.72■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 KCNQ1P51787 676 aa22.72■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.72■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 REPS2Q8NFH8 660 aa22.72■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.72■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.72■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 ZBBXA8MT70 800 aa22.71■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 HIP1O00291 1037 aa22.71■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 ATP2A1O14983 1001 aa22.71■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 TTC22Q5TAA0 569 aa22.71■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.236e-6■■■□□ 14.6
SGMS1-208ENST00000608287 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.7■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 ALX1Q15699 326 aa22.7■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.7■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.7■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.7■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.7■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.7■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 ZBED4O75132 1171 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 FGAP02671 866 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 ACTN1P12814 892 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 ARMCX2Q7L311 632 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 HLA-CQ95604 372 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 TSPY3P0CV98 308 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 TSPY8P0CW00 308 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 RABGGTBP53611 331 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 ITGA7Q13683 1181 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 CHST13Q8NET6 341 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 MCM3APO60318 1980 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 TFAP4Q01664 338 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 SLC9A7Q96T83 725 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 NYAP2Q9P242 653 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 OAZ1P54368 228 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 CCL23P55773 120 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 TNFAIP2Q03169 654 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 INCENPQ9NQS7 918 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 ZMYM6O95789 1325 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 KIF28PB7ZC32 967 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 TLL1O43897 1013 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 CEP95Q96GE4 821 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 MYH4Q9Y623 1939 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-208ENST00000608287 ASB14A6NK59 587 aa22.64■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 TSPY2A6NKD2 308 aa22.64■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 ADCY6O43306 1168 aa22.64■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 CA3P07451 260 aa22.64■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 FDX1P10109 184 aa22.64■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 TLK2Q86UE8 772 aa22.64■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms