RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 PRKCZQ05513 592 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 USH1GQ495M9 461 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 NECAB1Q8N987 351 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 RGS22Q8NE09 1264 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 GTF3C6Q969F1 213 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 ABCB11O95342 1321 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 CPLX1O14810 134 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 MCM2P49736 904 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 FLT3LGP49771 235 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 MMP19Q99542 508 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 MAF1Q9H063 256 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 COBLO75128 1261 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 CTDNEP1O95476 244 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 ADORA2AP29274 412 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 MAP2K5Q13163 448 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 IRF5Q13568 498 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 KCTD2Q14681 263 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 PHKBQ93100 1093 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 NFIBO00712 420 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 HOXC6P09630 235 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 ST3GAL1Q11201 340 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 PKN1Q16512 942 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF548-204ENST00000594693 OPLAHO14841 1288 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 CDKL5O76039 1030 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 RGS2P41220 211 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 DDX11Q96FC9 970 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 PFASO15067 1338 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 PPFIA3O75145 1194 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 PGK2P07205 417 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 CYP2B6P20813 491 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 GHRHRQ02643 423 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 DPP9Q86TI2 863 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 TBC1D5Q92609 795 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 TMX3Q96JJ7 454 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 MGAMO43451 1857 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 SCG2P13521 617 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 NSMFQ6X4W1 530 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 RAET1EQ8TD07 263 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 BARHL2Q9NY43 387 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 IGHA2P01877 340 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 APBA2Q99767 749 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 POTEB2H3BUK9 544 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 STXBP3O00186 592 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF548-204ENST00000594693 DEXIO95424 95 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms