RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLRK1	P26718	216 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRDX5	P30044	214 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	GRM4	Q14833	912 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF592	Q92610	1267 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	DHX58	Q96C10	678 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SBF2	Q86WG5	1849 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	C6orf229	H3BNL8	230 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARHGAP6	O43182	974 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TPM1	P09493	284 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TSPY3	P0CV98	308 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TSPY8	P0CW00	308 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPAG1	Q07617	926 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	C12orf60	Q5U649	245 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ISM2	Q6H9L7	571 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMC4	Q7Z404	712 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPATA20	Q8TB22	786 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF384	Q8TF68	577 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKRD7	Q92527	254 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	FANCL	Q9NW38	375 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	LAD1	O00515	517 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	MYL1	P05976	194 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATP1A3	P13637	1013 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF18	P17022	549 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	WNT7B	P56706	349 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TFAP4	Q01664	338 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPECC1	Q5M775	1068 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPATA1	Q5VX52	437 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDILT	Q8N807	584 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TAF1	P21675	1872 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SIAH2	O43255	324 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALDH1A1	P00352	501 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP2D6	P10635	497 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TM4SF1	P30408	202 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	HOMER1	Q86YM7	354 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	PAGE5	Q96GU1	130 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	GGA1	Q9UJY5	639 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP27X	A6NNY8	438 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	FOXN1	O15353	648 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	STX10	O60499	249 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	UFL1	O94874	794 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCNQ4	P56696	695 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	GRIN1	Q05586	938 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	DPYD	Q12882	1025 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRIM14	Q14142	442 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-222	ENST00000592408	NFIX	Q14938	502 aa		10.4	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms