RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588672.1

LDLRAD4-AS1-201, LDLRAD4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LDLRAD4-AS1, Length 2,190 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CEP135Q66GS9 1140 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CABP7Q86V35 215 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TMX1Q9H3N1 280 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PI4KBQ9UBF8 816 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PPIP5K2O43314 1243 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SLC37A4O43826 429 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GDF11O95390 407 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PLCG1P19174 1290 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SEPT2Q15019 361 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PTPN14Q15678 1187 aa15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KLRC4O43908 158 aa15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TXKP42681 527 aa15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PRCPP42785 496 aa15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 JAG1P78504 1218 aa15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TMEM139Q8IV31 216 aa15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KBTBD4Q9NVX7 518 aa15.37■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZBTB5O15062 677 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TNNI2P48788 182 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TATDN1Q6P1N9 297 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NELFBQ8WX92 580 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MTMR8Q96EF0 704 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 AK8Q96MA6 479 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MTMR9Q96QG7 549 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PAK1Q13153 545 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TC2NQ8N9U0 490 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RMND1Q9NWS8 449 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.36■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SLFN13Q68D06 897 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NYAP2Q9P242 653 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SLC1A4P43007 532 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SNAP25P60880 206 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CALCRLQ16602 461 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MKL1Q969V6 931 aa15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NRDCO43847 1150 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KCNJ6P48051 423 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ICA1Q05084 483 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ADSSL1Q8N142 457 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GJA10Q969M2 543 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PBX1P40424 430 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KRT31Q15323 416 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CUL5Q93034 780 aa15.34■□□□□ 0.05
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 POTEMA6NI47 508 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RAD17O75943 681 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GRB10Q13322 594 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KCNB1Q14721 858 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DCAF4Q8WV16 495 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 UIMC1Q96RL1 719 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LRWD1Q9UFC0 647 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.33■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CLRN2A0PK11 232 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 USP17L15C9J2P7 530 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 USP17L11C9JVI0 530 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 USP17L18D6R9N7 530 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 USP17L22D6RA61 530 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 USP17L19D6RCP7 530 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 USP17L20D6RJB6 530 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RHOBTB3O94955 611 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GH2P01242 217 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 USP17L24Q0WX57 530 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.32■□□□□ 0.04
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms